Diffusions scientifiques & techniques du PNDB
L'équipe du PNDB dans le cadre de ses activités est amené à présenter et/ou publier des informations scientifiques et techniques sous formes de :
Articles scientifiques
- Gonzalez A. et al., 2023. A global biodiversity observing system to unite monitoring and guide action. Nature in Ecology and Evolution. https://doi.org/10.1038/s41559-023-02171-0
- Hiltemann S. et al., 2023. Galaxy Training: A powerful framework for teaching! PLOS Computational Biology. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010752
- Pelletier D. et al., 2021. A Standardized Workflow Based on the STAVIRO Unbaited Underwater Video System for Monitoring Fish and Habitat Essential Biodiversity Variables in Coastal Areas. Frontiers in Marine Sciences. https://doi.org/10.3389/fmars.2021.689280
- Güntsch A. et al., 2024. National biodiversity data infrastructures - Ten essential functions for science, policy and practice. Bioscience. https://doi.org/10.1093/biosci/biae109
- Royaux c. et al., 2024. Guidance framework to apply good practices in ecological data analysis: Lessons learned from building Galaxy-Ecology. EcoEvoRxiv. https://doi.org/10.32942/X2G033
Résumés de conférences
- Lacoeuilhe A, Pamerlon S, Archambeau A-S, Denys GP, Le Bras Y, Norvez O (2023) An Overview of the French eDNA Data Landscape: Focus on a national technical repository of reference genetic sequences. Biodiversity Information Science and Standards 7: e110103. https://doi.or/10.3897/biss.7.110103
- Royaux C, Sananikone J, Arnaud E, Norvez O, Ainsa A, Morin S, Pamerlon S, Archambeau A-S, Le Bras Y (2022) French Biodiversity Data Hub: Linking local to global biodiversity through international initiatives and open science clouds. Biodiversity Information Science and Standards 6: e91374. https://doi.org/10.3897/biss.6.91374
- Royaux C, Norvez O, Jossé M, Arnaud E, Sananikone J, Pavoine S, Pelletier D, Mihoub J-B, Le Bras Y (2022) From Biodiversity Observation Networks to Datasets and Workflows Supporting Biodiversity Indicators, a French Biodiversity Observation Network (BON) Essential Biodiversity Variables (EBV) Operationalization Pilot using Galaxy and Ecological Metadata Language. Biodiversity Information Science and Standards 6: e94957. https://doi.org/10.3897/biss.6.94957
- Royaux C, Arnaud E, Sananikone J, Jossé M, Madelin M, Pelletier D, Norvez O, Le Bras Y (2022) Open Science for Better FAIRness: A biodiversity virtual research environment point of view. Biodiversity Information Science and Standards 6: e95110. https://doi.org/10.3897/biss.6.95110
- Sananikone J, Arnaud E, Norvez O, Pamerlon S, Archambeau A-S, Le Bras Y (2022) From Raw Data to Data Standards through Quality Assessment and Semantic Annotation. Biodiversity Information Science and Standards 6: e91205. https://doi.org/10.3897/biss.6.91205
Rapports / Synthèses
- Synthèses des ateliers du séminaire scientifique du PNDB (21 & 22 novembre 2023, Brest)
- Charpentier I., Pardo C. et al., 2024. Des données aux transformations des sociétés. Séminaire scientifique du PNDB, 21 & 22 novembre 2023. Disponible en ligne sur https://data-access.cesgo.org/index.php/s/BV7G4uNL1lxMwdW
- Garnier E., Le Bras Y., Norvez O. et al., 2024. Cadres d’acquisition et de mise à disposition des données et métadonnées : actuels et évolutions souhaitables?. Séminaire scientifique du PNDB, 21 & 22 novembre 2023. Disponible en ligne sur https://data-access.cesgo.org/index.php/s/HgVPIXxfQXRyt6W
- Luque S., Le Viol I., Alleaume S. et al., 2024. Méta-analyse et croisement des données hétérogènes : de l’in situ à la télédétection en passant par les sciences participatives. Séminaire scientifique du PNDB, 21 & 22 novembre 2023. Disponible en ligne sur https://data-access.cesgo.org/index.php/s/rncW6a6eu9IH0QE
- Basille M., Roche P. et al., 2024. Variables essentielles de biodiversité. Séminaire scientifique du PNDB, 21 & 22 novembre 2023. Disponible en ligne sur https://data-access.cesgo.org/index.php/s/mpjxd6aJsvM2FL5
- Delavaud A. et al. 2014. État des lieux et analyse des paysages des observatoires français de recherche sur la biodiversité. Expertise et synthèse de la Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité. Disponible en ligne sur www.fondationbiodiversite.fr/etat-des-lieux-et-analyse-des-paysages-des-observatoires-francais-de-recherche-sur-la-biodiversite/
- Norvez O., Milon T., Pamerlon S., Archambeau A.S., Bouix T., Cheminée O., Le Bras Y., Robert S., Vinet C., 2022. Comprendre, partager et ré-utiliser les données de biodiversité : Note explicative sur la complémentarité des systèmes d’information SIB - SINP - GBIF - PNDB. PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD) - Centre d’expertise et de données sur le patrimoine naturel. 23 pages. Etalab- 2.0.https://mnhn.hal.science/mnhn-04296424/document
Data papers
- Coché L. et al.. 2021. Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science. Biodiversity Data Journal. https://doi.org/10.3897/BDJ.9.e69022
Formations
- Casajus N, Coux C, Le Bras Y, Norvez O, Archambeau A-S & Pamerlon S (2024) Biodiversity data: From data collection to publication. An FRB-CESAB, PNDB & GBIF France training course. URL: https://biodiversitydata.github.io/