OpenMetaPaper

Résumé

« La nature décline globalement à un rythme sans précédent dans l’histoire humaine – et le taux d’extinction des espèces s’accélère, provoquant dès à présent des effets graves sur les populations humaines du monde entier ». Afin de mieux protéger nos écosystèmes, nous devons mieux les connaître, et pour ce faire, faciliter l’accès et le partage des informations générées et utilisées par les chercheurs pour construire la connaissance scientifique en commençant par l’ouverture la plus généralisée possible des données. Dans les disciplines scientifiques liées à la donnée de biodiversité, la culture du partage de la donnée n’est pas aussi ancrée que dans les disciplines de la biologie moléculaire par exemple. Pour autant, l’ouverture des données n’est pas suffisante et il est primordial d’y associer des métadonnées détaillées en utilisant des standards largement utilisés à l’international. Dans ce cadre, il apparaît que le domaine de l’écologie possède un avantage face à la multiplicité des standards existants au sein des communautés liées aux technologies *omiques : l’existence d’un langage de métadonnée dédié, modulaire et exhaustif, l’EML. Le projet OpenMetaPaper propose de compléter les initiatives existantes au niveau du Pôle national de données de biodiversité, et en lien avec notamment le GBIF et le projet GO FAIR BiodiFAIRse afin de booster l’ouverture des données de recherche en écologie et d’accélérer les initiatives en cours autour de l’utilisation du standard EML et de ses liens avec les autres standards de données et métadonnées en écologie et dans les disciplines proches. Particulièrement, le projet propose de mettre l’accent sur la publication scientifique, objet de recherche principal de la valorisation des activités scientifiques, en testant un dispositif permettant de :

Fonctionnement

 

 

Nota Bene : MetaShARK (pour Metadata Shiny Application for Resources and Knowledge) est un outil R&D financé par le Fond National pour la Science Ouverte, dans le cadre du projet OpenMetaPaper . Cet outil n'est pas disponible car actuellement en crash test interne

Data paper

Un data paper est une publication scientifique qui décrit précisément un jeu de données, et informe la communauté scientifique de son existence, de ses modalités et de son potentiel de réutilisation.

=> le qui, quoi, où, quand, commet, pourquoi des données = métadonnées

Source IRD : https://data.ird.fr/datapapers/ et adaptée

Cette valorisation de Data paper se fait en lien avec le GBIF France et dans le cadre du projet OpenMetaPaper (soutenu par le Fond National pour la Science Ouverte) qui vise à "booster" la plublication de data papers et de décrire finement les métadonnées

Pour aller plus loin autour des data papers : voir la documentation dédiée du service Information Scientifique et Technique du CIRAD

Financement

Ce projet est possible avec le concours financier du Fond National de la Science Ouverte (FNSO), dans le cadre de la politique générale "Science ouverte" du Ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche / numéro de projet : AAPFNSO2019OpenMetaPaper-14026