Tutoriels PNDB

Nous vous invitons à explorer ces différents tutoriels pour la prise en main d'outils développé par le PNDB et/ou ses partenaires

Outils du PNDB

**bientôt disponible**

Galaxy-Ecology (aka Galaxy-E) permet :

le nettoyage des données
la visualisation et les tendances
la personnalisation et/ou l’utilisation de cadre analytiques robustes et reproductibles
la production d’indicateurs

Questions :

Comment explorer les données de biodiversité ?
Comment regarder l'homoscédasticité, la normalité ou la colinéarité des données présences-absences ou abondance ?
Comment comparer la diversité bêta en tenant compte de l'espace, du temps et des composantes d'espèces ?

Objectifs:

Explorer les données Biodiversité avec des informations taxonomiques, temporelles et géographiques
Avoir une idée sur la qualité du contenu des données concernant les tests statistiques comme la normalité ou l'homoscédasticité et la couverture comme la couverture temporelle ou géographique

Questions :

Comment bien évaluer l'état biologique des populations et des communautés avec des données d'abondance?
Comment évoluent les populations exploitées au chalut de la mer Baltique, de l'Atlantique Sud et de l'Écosse au fil du temps ?
Comment calculer et analyser des métriques de biodiversité à partir de données d'abondance ?

Objectifs:

Télécharger des données depuis le portail DATRAS du CIEM
Pré-traiter les données démographiques avec Galaxy
Apprendre à utiliser un flux de travail d'analyse écologique des données brutes aux représentations graphiques
Apprendre à construire un modèle linéaire généralisé (mixte) à partir d'une question écologique couranteApprendre à interpréter un modèle linéaire généralisé (mixte

Questions :

comment analyser les données de metabarcoding ADN / eDNA produites sur les séquenceurs Illumina à l'aide des OBITools ?

Objectifs:

**bientôt disponible**